组织部工作职责：负责机关干部、人事管理工作；指导全市团的基层组织建设，协助党组织选拔、培养和管理干部，加强对团员的教育和管理。

办公室工作职责：负责协调机关各部室和直属单位的工作，承担机关文秘工作；承担机关效能建设工作；负责机关固定资产管理、财务管理和行政后勤事务。

宣传部工作职责：了解掌握青年的思想动态，指导全市青少年的思想理论教育；组织开展青少年宣传文体活动；指导全市共青团宣传工作；组织指导全市青年志愿者活动，承担市志愿者联合会秘书处的工作；负责厦门市青年运动史资料的收集、整理、研究和编写工作；指导全市青少年活动阵地的建设和管理工作。

经济部工作职责：研究、联系、指导城市、农村共青团工作；开展面向城市、农村青年的思想教育、就业创业、文明素质拓展、职业技能提高等工作，指导城、乡团的基层组织建设；指导、开展全市青年文明号、青年岗位能手、青年突击队的评选、表彰和日常管理、考核工作；协调、指导青少年生态环境保护，培养农村青年致富人才，指导市青年企业家协会、青年商会、青年创业协会工作。

学校部职责：指导全市大中专学校和中学团的建设，组织指导团员青年开展文化宣传、思想教育、社会实践和科技探索等活动；负责全市学校团干队伍建设，做好学校团干的培训工作；承担市学联秘书处的日常工作，指导全市大中专院校和中学学生会工作；指导全市少先队的工作，组织指导全市各级少先队组织开展各类主题教育活动；负责少先队辅导员队伍建设，做好少先队辅导员的培训工作；加强少先队校外教育工作；承担市少工委办公室的日常工作。

统战部工作职责：指导全市青年统战工作，联系和团结各族各界青年；承担市青联秘书处的工作，负责联系在厦的全国、省、市青联委员；负责全市青少年的对外交往工作，加强同海外和港澳台地区青年组织、社团的友好往来。组织实施“希望工程”活动。

市直机关团工委工作职责：作为团市委派出机构，负责指导市直机关系统共青团工作，了解掌握青年工作情况，反映青年的思想动态，做好团员、青年的思想政治工作，开展适合青年特点的各项活动；提高机关团员青年政治、文化、业务素质，发挥青年在机关工作中的积极作用，承担市直机关党工委布置的工作任务。

权益部工作职责：指导全市维护青少年权益工作；参与制定保护青少年健康成长的地方性法规，参与监督青少年法律、法规的执行；维护青少年合法权益，为青少年健康成长提供服务；会同有关部门做好预防青少年违法犯罪工作，协助政府做好未成年人保护工作，负责市综治委预防青少年违法犯罪工作领导小组办公室的日常事务。

机关党委工作职责：负责直属单位的干部、人事管理工作；负责机关和下属党支部的党务工作和党员管理工作，加强党的思想建设、组织建设和作风建设；负责机关的纪检工作，加强机关党风廉政建设；负责机关工、青、妇工作，丰富职工的业余生活。